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ANR Thiofilm

Publiée le : 14 janvier 2013

L'équipe EM2 a obtenu le soutien de l'ANR BIOADAPT pour le projet Thiofilm (ANR-12-ADAP-0013) intitulé "Rôle des biofilms dans l’adaptation et la variabilité génomique des bactéries du genre Thiomonas, impliqués dans les processus de remédiation naturelle dans les drainages miniers". Ce projet coordonné par Florence Ploetze, rassemble l'équipe EM2, l'equipe de Valérie Barbe au Génoscope et le laboratoire Transcriptome et Epigenome de Jean-Yves coppée, de l'Institut Pasteur. Ce projet a pour but d’identifier les mécanismes impliqués dans l’apparition de variants au sein de biofilms et qui expliqueraient comment les bactéries du genre Thiomonas évoluent et s’adaptent à leur environnement particulièrement toxique. Dans ce but, diverses approches seront développées pour étudier le rôle des biofilms dans l’adaptation d’écotypes du genre Thiomonas. En particulier, des approches de génomique comparative (séquençage haut débit) et fonctionnelle (protéomique LC-SRM, RNAseq), de génétique (mutagénèse) et de physiologie seront utilisées par les trois partenaires. Ces travaux permettront de comprendre quels sont les mécanismes d’adaptation de ces bactéries extrêmophiles, et plus généralement quels sont les facteurs qui favorisent l’apparition de variants résistants aux stress et le rôle des biofilms dans ces processus évolutifs.

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